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GeneMarker序列分析软件
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GeneMarker
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  • GeneMarker是国际生物信息学相关研究分析领域应用十分广泛的 DNA片断分析软件,旨在为领域科研人员、司法刑侦人员提供一个精确、快速、友好、自动化的数据分析平台。
    GeneMarker是DNA片段数据分析领域的一个整体解决方案,集成了STR分析,遗传家系处理、峰图定量分析等十几个功能强大的分析应用模块,从而使操作人员摆脱了繁琐、费时的中间步骤,直接对实验结果进行更深入的分析。
    GeneMarker还是一个开放的分析平台。作为一个独立于硬件厂商的软件产品,它不但可以支持多家厂商的数据格式,而且还不断增加对世界上各种最新DNA片断分析方法的支持,为您的研究工作提供更大的自由和持久不断的动力。

    GeneMarker 主要应用:

    GeneMarker 能够处理ABI、Amersham、Beckman、SpectruMedix等公司的毛细管电泳仪输出的DNA片断峰图数据。它的应用领域有:

    * 动、植物DNA短串连重复序列STR 数据分析
    * 遗传学及古生物学相关研究
    * 遗传家系绘图与孟德尔检验(支持Linkage、GeneHunter
    * 肿瘤学领域染色体杂合性缺失(LOH)分析,分析肿瘤患者染色体异常
    * 法医和亲缘鉴定研究,支持混合样本分析
    * DNA扩增片断长度多态性AFLP数据分析
    * 对多重连接探针扩增所得到的数据的分析
    * 高通量SNP分型及其聚类分析
    * 用于高通量染色体和DNA异常诊断的MLPA®数据分析
    * 微卫星不稳定性(MSI)数据分析
    * DNA定量比对分析
    GeneMarker 主要特点

    一、计算分析精确

    采用专业优化的信号处理算法,帮助排除检测系统带来的噪音和干扰,使实验结果的真实原貌得到更准确的还原。如基线校正(Baseline Subtraction),相关性消除(Pull-up Removal),饱和信号修补(Saturation Repair)等。采用多种统计方法辅助分析,如Stutter Recognition、False Plus-A Correction等,自动鉴别信号,以得到最合理精确的分型结果。

    二、快速分析数据及生成报告

    快速准确计算出等位基因(Allele)的位置,获得等位基因的Repeat Number。优化的算法保证了数据处理运算的快捷,在我们的测试中,处理1000个样本只需276秒。良好的设计保障了软件的稳定运行,即使发生了意外,内置的异常处理模块也能防止程序的崩溃,使用户能及时保存数据。

    三、友好的人机交互界面

    友好的人机交互界面设计,支持多家厂商的数据格式。界面简单、友好,十分容易掌握,还提供向导界面,引导用户轻松完成数据处理和报告输出。支持自定义内标,支持自定义panel。自动判断每个DNA片段的内标种类。丰富的报告打印类型, 输出Allele报告;输出CODIS报告。

    四、多个特殊定制功能

    集成多个功能强大的工具和应用,如MLPA分析多重连接探针扩增数据分析、定量分析功能、单倍体(Haplotype)分析功能、MS-MLPA®甲基特异性分析、家族图谱关联的微卫星分析等多达15种定制服务功能,并已得到全球2000多家实验室和研究机构良好的使用。
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